V Brazílii byl objeven virus s vědecky neznámými geny

V Brazílii byl objeven virus s vědecky neznámými geny
V Brazílii byl objeven virus s vědecky neznámými geny
Anonim

Vědci objevili v Brazílii nový virus, jehož DNA je z 90 procent vědně neznámým genům. Výsledky objevu jsou zveřejněny na webu předtisku bioRxiv.

Virus byl detekován v umělém jezeře Pampulha v brazilském městě Belo Horizonte. Jeho nepříliš složitý genom se skládá téměř výhradně z genů neznámých vědě. Autoři pojmenovali nový virus Yaravirus brasiliensis podle vodní nymfy Yara z mytologie národů Jižní Ameriky.

Vědci spekulují, že se potýkají s prvním případem neznámé izolované skupiny virů nebo vzdáleného druhu obřího viru, který se vyvinul do menší podoby.

Obří viry byly objeveny až v 21. století a dosahují velikosti srovnatelné s bakteriální buňkou. Dostali své jméno kvůli obrovským kapsidám - proteinovým membránám, které zapouzdřují viriony - virové částice. Mají také DNA příslušné délky, která přesahuje 200 tisíc párů bází a často obsahuje takzvané sirotčí nebo sirotčí geny (ORFan), které se nenacházejí v žádné jiné skupině organismů.

Složité genomy umožňují obřím virům syntetizovat proteiny a provádět opravu DNA, replikaci, transkripci a translaci. Před jejich objevem se věřilo, že viry nemají takové schopnosti, protože jsou to inertní tvorové, kteří mohou infikovat pouze své hostitele. Všechny známé obří viry jsou parazity améb.

A přestože je velikost nového mikroorganismu výrazně menší než u obrovských virů - asi 80 nanometrů - parazituje také na amébách a jeho genom je téměř zcela sirotek: 68 jeho genů (více než 90 procent) nenalezlo analogy v jakýkoli známý organismus, a jen šest nejasně se podobá těm známým vědě.

„Je to proto, že virus je novou linií amébového viru s úžasným původem a fylogenezí,“uvedl v tiskové zprávě jeden z vedoucích studie Jônatas Abrahão z Federální univerzity Minas Gerais v Brazílii.

Vědci analyzovali více než osm a půl tisíce metagenomů, ale nenašli mezi nimi viry související s novým mikroorganismem. Stejně jako ostatní viry této skupiny je reprezentován dvouvláknovou DNA, jejíž délka je 44 900 párů bází a obsahuje 74 kódujících fragmentů.

"Při použití standardních protokolů nebyla naše první genetická analýza schopna detekovat rozpoznatelné kapsidové sekvence nebo jiné klasické virové geny v yaraviru," vysvětluje Yonatas Abrajao a druhý vedoucí studie Bernard La Scola z Aix-Marseille University ve Francii.

Podle oficiálních metagenomických protokolů nelze yaravirus uznat ani za virového agenta, protože s nimi nemá žádnou jasnou podobnost. Vědci zatím nedokážou říci, čím doopravdy je - představitelem zcela nové skupiny nebo potomkem obřího viru, který se nějak vyvinul do menší podoby.

„Počet neznámých proteinů, které tvoří částice yaraviru, odráží variabilitu, která existuje ve virovém světě, a kolik nových virových genomů musí být dosud objeveno,“uzavírají autoři.

Doporučuje: