Vědci objevili v lidském střevě 140 tisíc druhů virů

Vědci objevili v lidském střevě 140 tisíc druhů virů
Vědci objevili v lidském střevě 140 tisíc druhů virů
Anonim

Britští genetici oznámili dokončení rozsáhlé studie ke studiu virové rozmanitosti lidského střevního mikrobiomu. Výsledkem práce byla identifikace asi 140 tisíc typů virů obývajících střeva, z nichž více než polovina nebyla nikdy dříve pozorována. Článek byl publikován v časopise Cell.

Lidské střevo je neuvěřitelně rozmanité biologické prostředí. Kromě bakterií existují desítky tisíc virů nazývaných bakteriofágy, které mohou infikovat bakterie. Je známo, že nerovnováha ve střevním mikrobiomu často vede k rozvoji zánětlivých onemocnění střev, alergií a obezity, ale relativně málo je známo o tom, jak bakteriofágy ovlivňují lidské zdraví.

Studie provedená Sengerovým institutem a Evropským institutem pro bioinformatiku (EMBL-EBI) analyzovala více než 28 000 vzorků střevního mikrobiomu shromážděných od lidí z celého světa.

Pomocí metody metagenomiky - sekvenování DNA smíšeného společenství organismů, autoři identifikovali a katalogizovali 142 809 typů virů, z nichž více než polovina se dosud nikdy nesetkala. Počet a rozmanitost virů vědce ohromila.

"Je důležité si uvědomit, že ne všechny viry jsou škodlivé. Jsou nedílnou součástí střevního ekosystému," řekl spoluautor Dr. Alexandre Almeida v tiskové zprávě Senger Institute. Střeva a je zajímavé zjistit spojení mezi nimi a lidským zdravím “.

Autoři poznamenávají, že většina detekovaných virů není pro člověka nebezpečná, protože mají jako svůj genetický materiál DNA a liší se od nebezpečných virů RNA, jako je SARS-CoV-2 nebo virus Zika. Jako důkaz byly všechny vzorky získány od zdravých lidí, kteří neměli žádné specifické nemoci.

Mezi desítkami tisíc identifikovaných virů byla autory označena nová clade - skupina virů, o nichž se věří, že mají společného předka - gubaphage. Bylo zjištěno, že tento kladu je druhým nejčastějším v lidském střevě po bakteriofágu crAssphage objeveném v roce 2014.

Výsledky studie vytvořily základ střevní fágové databáze GPD, která bude podle vědců neocenitelným zdrojem pro ty, kteří studují bakteriofágy a roli, kterou hrají při regulaci lidského zdraví.

"Výzkum bakteriofágů v současné době prochází renesancí. Tento vysoce kvalitní, rozsáhlý katalog lidských střevních virů se objevil ve správný čas, aby sloužil jako základ pro budoucí výzkum virů," řekl vedoucí studie Dr. Trevor Lawley.

Autoři poznamenávají, že hlavním rysem jejich práce bylo zajistit nejvyšší kvalitu rekonstruovaných virových genomů. Důsledná kontrola kvality v kombinaci s přístupem strojového učení poprvé umožnila získat kompletní virové genomy, které podle vědců budou tvořit základ pro vývoj nových terapií využívajících antimikrobiální bakteriofágová léčiva.

Doporučuje: